背景资料：某综合商场工程，建筑面积85000㎡，筒体结构。地下3层，地上55层，建筑高度约260m。基坑深度8m，部分地下结构采用地下暗挖施工工艺与地铁站相连。首层大堂高度为9m，跨度为12m。地上1至5层采用玻璃幕墙装饰，幕墙最高处高度为25m，局部采用高度为50米的悬挑式脚手架施工。吊装施工垂直运输采用内爬式塔吊，单个构件吊装最大重量为35t。总承包施工单位将部分劳务作业分包给A劳务公司。
合同履行过程中，发生了下列事件：
事件一：施工总承包单位编制了土方开挖工程等危险性较大分部分项工程安全专项施工方案，经专家论证，施工单位项目技术负责人和总监理工程师签字后组织实施。
事件二：监理工程师对混凝土柱、墙、梁进行施工质量检查中，发现部分构件的外形尺寸偏差很大，向施工总承包单位提出了整改要求。
事件三：由于工期较紧，施工总承包单位于晚上11点后安排了钢结构构件进场和打桩作业，并未办理夜间施工的相关许可文件。
事件四：由于土源紧缺，施工单位将部分有毒有害废弃物作为土方回填。为了尽快与市区主管道完成对接，施工单位擅自对周围市区主干道封路4小时，造成车辆大量拥堵，热心市民找到当地媒体对其行为进行曝光。
指出事件二中问题产生的原因可能有哪些?如何防止此类问题再次发生?
